Амёба протей названа так, потому что она постоянно изменяет свою форму, напоминая способность Протея в древнегреческой мифологии менять облик. Эти изменения формы обусловлены движением её псевдоподий (ложноножек), которые она использует для передвижения и захвата пищи. Таким образом, её изменчивость и пластичность связаны с её биологическими особенностями.